ดูเหมือนเรื่องที่ Meat Boy และ Bandage Girl หนีรอดจากห้องทดลองที่กำลังระเบิดบนท้องฟ้าเพิ่งเกิดขึ้นเมื่อวาน ในปีนี้ ทั้งคู่มี Nugget ลูกสาวที่เพิ่งลืมตาดูโลก ช่วงเวลาที่พวกเขาใช้ชีวิตในฐานะครอบครัวกำลังจะจบลงอย่างกระทันหันเมื่อ Dr. Fetus จู่โจมทั่งคู่ด้วยพลั่วขึ้นสนิมจนสลบ และลักพาตัว Nugget ไป ในตอนนี้ขึ้นอยู่กับ Meat Boy และ Bandage Girl ที่จะช่วยเหลือลูกสาวของตนจากทารกวิกลจริตในขวดโหลที่เปรียบเหมือน Nikola Tesla ในเวอร์ชันไร้เพื่อน