感覺起來，Meat Boy 和 Bandage Girl 逃離天空爆炸實驗室這件事，好像昨天才發生而已。而今年他們的女兒 Nugget 就已經誕生到這個世界上了。然而當 Dr. Fetus 用腐鏽鐵鍬痛擊他們，並綁架了 Nugget 的那刻起，他們幸福的家庭生活一夕破碎！現在，Meat Boy 和 Bandage Girl 的女兒被一個住在罐子裡、老是把不到妹的瘋狂天才科學家抓走了，他們必須出馬解救她。